Mi opinión sobre Bootstrap se mantiene porque honestamente pienso que utilizarlo no te hace perder la identidad. Sin embargo es cierto que utilizar el tema por defecto puede ocasionar que a nivel estético los sitios se parezcan.
Para solucionar este pequeño inconveniente sin perder tiempo existe Bootswatch, un proyecto que recopila temas gratuitos para utilizar junto a Bootstrap.
La instalación es sencilla, solo debemos descargar los archivos CSS y reemplazarlos en Bootstrap, esto sin perder una sola funcionalidad original. Todos los themes son open source, liberados bajo licencia Apache 2.0 y mantenidos por la gran comunidad de Github que contribuyen todo el tiempo incorporando nuevos estilos.
Otra de las ventajas de los temas recogidos en este proyecto es que funcionan perfectamente con la ultima versión de Bootstrap lo que permite mantener al 100% las características nuevas de este recurso.
Para los fanáticos de la eficiencia Bootswatch tiene una buena noticia, todos los archivos adjuntan su versión para LESS.
Si el proyecto les parece interesante les recomiendo seguirlo por algunos de los canales sociales, están liberando nuevos temas todo el tiempo.